A、④细胞核是细胞生命活动控制中心，A正确；B、（3）属于植物的输导组织，B错误；C、（2）种子中储存的营养物质是由（3）中的筛管输送来的，C正确；D、植物体的结构层次从微观到宏观依次是细胞→组织→器官→植物体．图中的（1）是细胞，（2）种子属于器官，（3）属于输导组织，所以从结构层次上看，由微观到宏观的排列顺序为（1）→（3）→（2），D正确．故选：B
