A选项是正确的。
本句是一个简单句，没有任何的引导词。所以后面的短语应该是名词性短语做补充的状语，用来说明Bill为什么是一名好学生。这样，完整的句子就变成了Bill is a good student,mathematics being his best subject.mathematics是这个短语中的逻辑主语。
如果写成mathematics is his best subject，必须在句中加上一个引导词，如as等。或者在中间加and，这样就成了两个并列句了。
记住一点，逗号不能连接两个简单句子。
a:mathematics being，独立结构。
要用“mathematics is ”，需要“and mathematics is”，用and连接两个分句。
选择A，因为没有连词链接，所以后面的小句为“无谓句”.
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