像你这种情况，如果存在的帐目问题具有普遍性的话，那么，根据税收征管法的规定，税务机关有权依法变更你的纳税方式，变查帐征收为查定征收（即所谓的带征税，也就是你说的按照销售收入与带征税税率的乘积进行简易征收）；如果存在的问题不具有普遍性。属于偶而错误的话，税务机关一般不会核定你按查定征收方式申报纳税。
上述情况的判断，取决与税务机关的认定，不可避免地存在着一定程度的主观因素。如果你公司仍然想维持查帐征收方式的话，你应当向税务机关做出一些合理的解释和整改的措施，以取得税务机关的谅解和信任。从题中看，税务机关的行为是有法律依据的。当务之急是你与税务机关的沟通。祝好运。
楼上的回答很专业哦，我支持．
赶快健全手续。
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