A、自然选择是导致基因频率变化都因素之一，A错误；B、基因突变、染色体变异是基因频率变化都因素之一，B错误；C、迁入和迁出是导致基因频率变化都因素之一，C错误；D、同一群个体间的自由交配不能导致种群基因频率改变，D正确．故选：D．
