A、果蝇的性别决定为XY型，雌果蝇为XX，雄果蝇为XY，A正确；
B、细胞中染色体组的判断方法：细胞内形态、大小相同的染色体有几条，则该细胞中就含有几个染色体组，此细胞中形态、大小相同的染色体有两条为两个染色体组，B正确；
C、同源染色体的形态和大小一般相同，一条来自父方一条来自母方，此细胞中有4对染色体形态大小相同为4对同源染色体，C正确；
D、细胞中的一组非同源染色体，它们在形态和功能上各不相同，但是携带着控制一种生物生长发育、遗传和变异的全部信息，这样的一组染色体，叫做一个染色体组，此细胞中的一个染上色体组包括Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ、X，D错误；
故选：D．
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