①长期盛放石灰水的试剂瓶内壁常有一层白色固体物质碳酸钙，硫酸和碳酸钙反应生成的硫酸钙是微溶物，会附着在试管壁上，不能洗净，常用盐酸来洗，故①错误；
②中和滴定中所用的锥形瓶用待测溶液润洗，会导致消耗的标准液体积增大，计算所测溶液的物质的量浓度偏大，故②错误；
③铜可以和三氯化铁溶液反应，生成氯化亚铁和氯化铜，三氯化铁溶液可以除去留在试管内的铜，故③正确；
④pH试纸不能用蒸馏水来润湿，测定某溶液的pH时，先将pH试纸放在表面皿上，再用洁净、干燥的玻璃棒蘸取该溶，液点在试纸上，并与标准比色卡比较，故④错误；
⑤分液时，分液漏斗中下层液体从下口放出，上层液体从上口倒出，故⑤正确；
⑥蒸馏的原理：通过控制沸点的不同来实现物质的分离，所以温度计水银球要靠近蒸馏烧瓶支管口，故⑥正确．
故选D．
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