主要有磺胺类、球痢灵、氯羟吡啶、氯苯胍、氨丙啉、尼卡巴嗪、痢特灵、常山酮、氟嘌呤、地克珠利、百球清、二甲硫胺、喹啉类等。
化学合成药对球虫的作用机制较复杂,有的影响球虫发育过程,如磺胺类药与对氨基苯甲酸竞争二氢叶酸合成酶,妨碍二氢叶酸合成,最终影响核蛋白的合成,如氨丙啉阻断虫体细胞的糖代谢过程,干扰球虫维生素B1的代谢;有的影响虫体的线粒体功能,如喹啉类和吡啶类阻断球虫线粒体内细胞色素体系的电子运输。化学合成药对球虫的作用峰期较广,可从子孢子到配子体,但各种药物的作用峰期有所差异。化学抗球虫药通常有一个较广的活性范围,高效能,但具有较大的产生抗药性的潜能、仅能产生有限的免疫,有时还存在毒性,且通常比离子载体类药物价格昂贵些。化学药物和离子载体类抗球虫药穿梭使用可以延长一些化学药物,如尼卡巴嗪的使用寿命。 此类药物包括苯甲氧喹啉、癸氧喹啉和丁氧喹啉三种药物,甲氧喹啉的药效比癸氧喹啉强2倍,比丁氧喹啉强10倍,主要作用于孢子。此类药品的用药成本较高,极易产生抗药性,应用价值有限。
上述两类抗球虫药中,拉沙里菌素、马杜拉霉素、地克珠利、速丹、尼卡巴嗪、氯苯胍的抗球虫效果较好。百球清是一个非常好的抗球虫药,使用方便,由于其价格较贵,主要作为治疗用药。莫能菌素、那拉霉素、克球粉、盐霉素、球痢灵、氨丙啉、痢特灵效果稍差。一般抗球虫药峰期在感染后1、2天的药物,如喹啉类、克球粉、离子载体类药物,抗球虫效果弱一些,适用于预防用药或早期用药;而作用峰期在感染后3、4天的药物,其抗球虫效果较强,适宜做治疗药物。任何一种药长期使用或不规范用药,都会出现药效下降,甚至完全失效。