如何快速找出targetscan,PicTar,miRanda所预测靶基因的交集

2025-06-27 19:51:53
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回答1:

只是找交集的话excel就可以吧:先对靶基因排序,然后执行函数“=if(A1=A2,"same","")”就可以看到哪些基因被多次预测。
R语言里的Venn package则可以快速计各个结果相互之间的overlap情况。

不过,pictar预测出来的是NM编号的转录本,而非基因名;
而targetscan和miRanda预测出来的是基因名。
所以找交集时候需要注意。